La serie sigue a Olivia Dunham (Anna Torv), Peter Bishop (Joshua Jackson) y Walter Bishop (John Noble), quienes son miembros de la División Fringe del FBI, bajo órdenes del Departamento de Seguridad Nacional. El equipo utiliza métodos no convencionales para ayudar a investigar diversos casos aparentemente inexplicables, que están relacionados con un misterioso universo paralelo. La serie ha sido considerada como una mezcla entre The X-Files, Altered States y The Twilight Zone.